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La théorie des endosymbiotes.
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Image en microscopie de Streptomyces coelicolor. Ces bactéries filamenteuses, impliquées dans la décomposition du sol. Leur intérêt en industrie tient à la diversité des produits qu’elles fabriquent, notamment de nombreux antibiotiques. C. John Innes Centre.
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Depuis quelques années, les biologistes avancent l’hypothèse suivante : aux origines de la vie, les procaryotes (organismes sans noyau) initiaux auraient évolué en eucaryotes primitifs, c’est-à-dire avec un noyau, pour protéger leur ADN des bactéries dont ils se nourrissaient. On pense que ces eucaryotes ont progressivement absorbé puis conservé ces cellules dites alpha-protéobactériennes. Ces dernières auraient progressivement perdu leur autonomie et auraient transféré une partie de leurs gènes au noyau de leur hôte, se transformant en mitochondries. De même, chez les plantes eucaryotes porteuses de mitochondries, ce serait l’absorption de cyanobactéries qui aurait donné naissance aux chloroplastes.
Les bactéries des grands fonds
Température, lumière, concentration d’oxygène et de matière organique, salinité et acidité, sont des paramètres clés qui définissent l’hospitalité d’un milieu aux êtres vivants. C’est tout du moins ce que l’on croyait avant 1980, et la découverte, par plus de 5000 m de fond, d’une vie étrange qui s’agglutine autour de "sources hydrothermales", véritables cheminées volcaniques, crachant des fluides à plus de 350°C. En fait, on soupçonnait déjà l’existence d’animaux barophiles, après que l’on ait isolé à la fin des années 70, des bactéries vivant dans l’appareil digestif d’invertébrés des abysses (amphipodes, holothuries…). L’une des bactéries les plus remarquables, étudiée par l’équipe de Daniel Prieur est Thermococus barophilus qui est à la fois barophile et hyperthermophile (voir glossaire°. Une surprise, les bactéries baro-thermophiles sont mieux adaptées, en laboratoire, à des pressions supérieures à celle de leur environnement d’origine. Cela pourrait signifier qu’elles viennent de régions encore plus profondes ?
Les effets des antibiotiques sur les bactériesLes effets des antibiotiques sont extrêmement divers puisqu'ils dépendent de l'antibiotique, du germe étudié, de l'état physiologique de la bactérie ou du champignon inférieur, de l'environnement d'étude (in vitro, conditions physiques et chimiques, in vivo, organe considéré). En pratique on étudie l'effet des antibiotiques essentiellement in vitro et dans des conditions normalisées de culture. Pour les bactéries, le milieu de culture est le milieu dit de Mueller-Hinton dont la composition est maintenue aussi constante que possible par les fabricants, le pH d'étude est 7,2, la température d'étude est de 35 à 37 °C, l'atmosphère (aérobie/anaérobie) dépend des exigences du germe. L'effet des antibiotiques n'est que rarement étudié au niveau cellulaire, c'est l'effet sur la population bactérienne qui est analysé. Le résultat final est donc statistique et ne reflète pas les réactions d'un individu microbien donné.
Source : Faculté de médecine de l’université de Lyon sud. |
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7 juin 2000/
Colloque de microbiologie Quimper :
Le laboratoire de microbiologie appliquée de Quimper et le laboratoire de microbiologie marine de l’IUEM organisent le troisième colloque de Microbiologie. Comme pour les deux précédents colloques (1997 et 1998), les microbiologistes du Finistère (Université, CNRS, Ifremer, Inra, Museum, Collège de France, centres techniques, industriels, etc.) se retrouveront pour exposer leurs travaux.
Glossaire Anaérobie : sans oxygène
Antibiotiques : substances ayant la propriété d’empêcher la croissance des micro-organismes ou de les détruire.
Autotrophes : capables de se développer à partir d’éléments non organiques (minéraux, métaux, gaz…).
Barophile : adapté aux grandes pressions.
Hétérotrophes : se dit de bactéries qui ne peuvent vivre qu’à partir d’éléments organiques.
Plasmide : élément d’ADN extra-chromosomique.
Thermophile : adapté aux températures supérieures à 60°c.
Liste de sites webs
De l’atome à l’organisme http://christian.combettes.free.fr/delatomelorgan/
Une liste complète des noms de bactéries (recense 1247 bactéries différentes) http://www-sv.cict.fr/bacterio/
Site du programme Britta
http://www.cbb-developpement.com/abonnes/frames.htm
et
http://www.region-bretagne.fr/french/ recherche/soutiens/3e6.htm
Dictionnaire de bactériologie vétérinaire : http://www.cict.fr/bacterio/bacdico/garde.html
Le monde des Procaryotes : http://members.aol.com/avallet03/ microbio/procaryotes.htm
Service " Valorisation des produits " de l’Ifremer : http://www.ifremer.fr/francais/org/drvvp.htm
Centre de biotechnologies en Bretagne : http://www.cbb-developpement.com/
Centre de compétences en agroalimentaire : http://www.adria.tm.fr
Centre d’étude et de valorisation des algues http://www.ceva.fr
Laboratoire de microbiologie et sécurité alimentaire de Brest http://www.univ-brest.fr/Recherche/ Laboratoire/MSA/ |